從凈化工程角度出發(fā)，制藥車間和工業(yè)無塵車間的建設(shè)凈化工程有著太多的相似性：兩者都是高科技高附加值的重點行業(yè)，都以無塵室為生產(chǎn)核心區(qū)域，都需要高精度的暖通、純水、特氣等系統(tǒng)作為生產(chǎn)支持，都設(shè)計要求較高投資較大等，這些相同之處使得凈化工程公司積極拓展業(yè)務(wù)，但兩者還有一定的差異，尤其是一些對產(chǎn)品質(zhì)量有重大影響的差異。
1、風(fēng)險和風(fēng)險控制的差異
風(fēng)險和風(fēng)險控制的差異是兩者差異的根源：制藥車間產(chǎn)品(也就是藥品)出現(xiàn)殘次品將直接影響到人的健康，影響巨大。因此，兩者對風(fēng)險的理解和風(fēng)險的控制有著較大的差異，這也導(dǎo)致了后面諸如水、電、暖、控、文件、驗證等系統(tǒng)的差異。
2、暖通(空調(diào))系統(tǒng)的差異
無塵室首先是從電子行業(yè)提出并發(fā)展壯大的，電子行業(yè)為了有效地控制微量雜質(zhì)，以保證微電子，面板晶體元電子電路這些高科技產(chǎn)品的成品率和可靠性，是早應(yīng)用無塵室的一批行業(yè)，之后無塵室在電子、核工業(yè)、航空航天、制藥、精密機械、化工、食品、化妝品等行業(yè)得到廣濟應(yīng)用。制藥車間為了對細(xì)菌和塵埃粒子進行控制，也是以無塵室為生產(chǎn)的核心區(qū)域。制藥車間和工業(yè)無塵車間在暖通系統(tǒng)上有很多相同點，都需要設(shè)計一定面積的無塵室，都需要在人流物流動線中設(shè)置更衣區(qū)域或緩沖區(qū)域，都需要在溫度、濕度、壓力、壓差、塵埃粒子等方面進行檢測和控制等等。但兩者在暖通系統(tǒng)上也有一些不同，這些不同點主要有：工業(yè)無塵車間的潔凈等級要求要高于制藥車間，要求高的工業(yè)無塵車間有十級和一級，一般制藥車間以萬級、十萬級居多，要求高的制藥車間有千級和局部百級，(局部百級是指房間是千級或萬級，但房間內(nèi)的某設(shè)備內(nèi)部空間是百級，而非房間百級)，制藥車間沒有十級和一級的無塵室。由于靜電對電子產(chǎn)品有比較大的影響，因此工業(yè)無塵車間的濕度控制要求比較嚴(yán)格，而制藥車間對濕度要求比較寬泛，尤其是原料藥或者封裝成品藥對房間濕度控制往往是“名存實亡”，有加濕設(shè)備但日常不需要運作，設(shè)計中需要弱化以節(jié)約成本。和工業(yè)無塵車間相比，制藥車間的空調(diào)系統(tǒng)需要有消毒滅菌的設(shè)備，一般通過在AHU(組合式空調(diào)箱)中增加臭氧發(fā)生器、甲醛熏蒸設(shè)備、氣態(tài)過氧化氫(VHP)發(fā)生器中的一種或多種來實現(xiàn)(GMP要求需要兩種或兩種以上的滅菌方式以排除細(xì)菌的抗藥性影響)。防靜電要求和滅菌要求的差異影響到庫板的選型，工業(yè)無塵車間的庫板需要選擇防靜電的庫板，制藥車間沒有此方面的要求，另外制藥車間的排氣系統(tǒng)也是設(shè)計中的重點，從生物安全性考慮，一些關(guān)鍵房間的排氣要增加過濾網(wǎng)，防止細(xì)菌或病毒被排放到大氣中。工業(yè)無塵車間因為可能使用砷、鎵、氟等有毒有害氣體，其排氣往往需要經(jīng)過洗滌塔處理，而且工業(yè)無塵車間排氣量要比制藥車間大的多，新風(fēng)補充量也要大得多。
3、廠房結(jié)構(gòu)的差異
工業(yè)無塵車間是人員密集型產(chǎn)業(yè)，加上產(chǎn)量大，產(chǎn)品價值密度相對比較低(產(chǎn)品價值密度是指單位體積的產(chǎn)品價值，醫(yī)藥產(chǎn)品一般是按克或者毫克計量，產(chǎn)品價值密度要比工業(yè)無塵車間大幾個數(shù)量級)，往往工業(yè)無塵車間都設(shè)計的比較大，經(jīng)常能見到幾萬甚至幾十萬平方米的無塵室，而制藥車間一般為幾千平方米的無塵室，上萬平方米無塵室的制藥車間鳳毛麟角。結(jié)構(gòu)方面，很多工業(yè)無塵車間采用“三明治”結(jié)構(gòu)，三明治結(jié)構(gòu)是指上層為送風(fēng)層，中層是生產(chǎn)廠房，下層是回風(fēng)夾道，這種結(jié)構(gòu)適合大空間廠房，制藥車間一般采用常規(guī)無塵室設(shè)計，使用送風(fēng)管路和回風(fēng)管路，沒有“三明治”結(jié)構(gòu)中的送回風(fēng)層。“三明治”結(jié)構(gòu)的中層地面多使用高架地板的設(shè)計，可以更好的控制氣流方向，另外上下夾層設(shè)置DDC (干盤管)，多使用FFU+MAU(風(fēng)機過濾機單元+新風(fēng)機組)等都是工業(yè)無塵車間的特色，制藥車間一般只是常規(guī)的AHU設(shè)計即可。和高大的工業(yè)無塵車間房不同，制藥車間更側(cè)重控菌和無菌的設(shè)計，往往房間比較小以方便控制氣流流向，更衣程序復(fù)雜，進出采用更衣室的設(shè)計，而非風(fēng)淋室設(shè)計，另外制藥車間一般不采用閉門器，在庫板連接處采用R角的結(jié)構(gòu)，采用“中字吊梁”而非工業(yè)無塵車間采用的“酒杯梁”的等，這些差異都源于制藥車間的無塵室的控菌、滅菌的要求。
4、水系統(tǒng)的差異
工業(yè)無塵車間用到的水一般叫做RO水和超純水，類似水質(zhì)在制藥車間叫做純水和注射水。工業(yè)無塵車間的RO水和制藥車間的純水都是用反滲透原理制備，設(shè)備相似，水質(zhì)相似，都屬于過渡水，制藥車間因為需要熱消毒，在RO膜之后要使用不銹鋼材質(zhì)，要求嚴(yán)格的制藥車間一般從原水就開始使用不銹鋼材質(zhì)。單從水質(zhì)上來講，工業(yè)無塵車間的超純水要強于制藥車間的注射用水，工業(yè)無塵車間的超純水一般為18M超純水(18M= 0.05m/c m)，制藥車間法規(guī)要求的注射水是<0.20m/cm即可。
工業(yè)無塵車間的超純水采用混床方法制備，采用1供2回同程回路供水，不需要考慮死角和消毒滅菌；制藥車間的注射用水采用蒸餾法制備，采用一供一回的大回路循環(huán)，用水點有防死角的設(shè)計和設(shè)備選型，往往和純蒸汽發(fā)生器配合使用，需要有純蒸汽滅菌。在消防水系統(tǒng)方面，工業(yè)無塵車間的噴淋頭在無塵室里面和送回風(fēng)夾層里面，在制藥車間的消防方面有一個矛盾的地方，從消防法規(guī)要求，噴淋頭、排煙口需要設(shè)置在無塵室內(nèi)部，但從GMP的要求，有潔凈等級的無塵室內(nèi)不可以設(shè)置噴淋頭、排煙口，因為噴淋頭有死角，國內(nèi)常規(guī)的做法是無塵室內(nèi)不設(shè)置消防噴淋和排煙(但需要設(shè)置消火栓)，在上夾層中設(shè)置消防噴淋和排煙。由于工業(yè)無塵車間規(guī)模大，需要有很多節(jié)能方面的設(shè)計，如設(shè)置7℃-12℃和14℃-20℃兩組冷卻水回路，制藥車間規(guī)模比較小一般只采用一組即可；工業(yè)無塵車間的純水機組一般設(shè)置板式換熱器提高水溫以提高純水制水率，制藥車間純水機組雖然也有換熱器，但目的是熱消，而非提高純水制水率。
5、文件系統(tǒng)的差異
工業(yè)無塵車間的文件和大多數(shù)工廠相似，只需要達到業(yè)主需求即可，一般只需要現(xiàn)場驗收資料，相比制藥車間項目，因為對藥品安全質(zhì)量的嚴(yán)格要求，制藥車間需要有完整的文件驗證體系，主要包括URS(用戶需求描述)、VMP(驗證計劃)、RA(風(fēng)險分析)、FDS(功能規(guī)范描述)、DQ(設(shè)計確認(rèn))、IQ(安裝確認(rèn))、OQ(操作確認(rèn))、PQ(運行確認(rèn))等文件，當(dāng)然也包括FAT(工廠驗收)、SAT(現(xiàn)場驗收)這些通用驗收文件，以上文件一般稱為GMP驗證文件或者說4Q驗證文件，在凈化工程建設(shè)中，制藥車間GMP驗證文件的編寫要耗費相當(dāng)?shù)娜肆?、物力、財力。工業(yè)無塵車間一般不需要單獨設(shè)置資料室，但制藥車間需要設(shè)置專門的文件檔案室以存放資料文件，而且要配備非水消防系統(tǒng)。
6、造價的差異
工業(yè)無塵車間面積大，潔凈等級高，凈化工程方面造價(非專業(yè)設(shè)備造價)往往達到幾億元甚至十幾億元，相比，制藥車間由于面積小，潔凈等級低，一般幾千萬元的造價就算比較大的項目，從單位面積造價來看，工業(yè)無塵車間一般要比制藥車間高很多。
7、結(jié)論
制藥車間和工業(yè)無塵車間雖然在建設(shè)凈化工程方面有很多共性，但兩者還存在一些差異：
（1）風(fēng)險和風(fēng)險控制的差異。
（2）暖通(空調(diào))系統(tǒng)中的：潔凈等級的差異、靜電要求差異、滅菌設(shè)計差異、庫板質(zhì)量要求差異、排氣系統(tǒng)差異等。
（3）廠房結(jié)構(gòu)方面的：規(guī)模和密度的差異、結(jié)構(gòu)差異、DDC/ FF U/ M AU/A H U設(shè)備使用的差異、更衣設(shè)計差異、閉門器差異、R角設(shè)計差異、吊梁設(shè)計差異等。
（4）水系統(tǒng)中的：純水超純水系統(tǒng)差異、消防設(shè)計差異、節(jié)能設(shè)計差異等。
（5）文件系統(tǒng)的差異和資料室設(shè)計的差異等。
（6）造價的差異等。